Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1E1P36543 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms