Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5C1P36542 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms