Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms