Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXD12P35452 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms