Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL9P32969 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL9P32969 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL9P32969 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL9P32969 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms