Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA13P31271 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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