Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPREP23469 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPREP23469 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPREP23469 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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