Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms