Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF3P18847 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF3P18847 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms