Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VPREB1P12018 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms