Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GIMD1P0DJR0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms