Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTNP04004 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTNP04004 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTNP04004 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTNP04004 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VTNP04004 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VTNP04004 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms