Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA4FO95754 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA4FO95754 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms