Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPO95166 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms