Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F6O75461 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F6O75461 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F6O75461 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms