Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPHP4O75161 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms