Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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