Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC11O43248 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms