Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms