Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms