Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HMGB1P1B2RPK0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HMGB1P1B2RPK0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms