Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VWA8A3KMH1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VWA8A3KMH1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms