Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMX2A2RU54 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms