Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP20Q9Y2K6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms