Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC4Q9Y296 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms