Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNX7Q9UNH6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms