Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXL4Q9UKA2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FBXL4Q9UKA2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms