Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEFF2Q9UIK5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms