Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNAL1Q9UBT7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms