Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VPS29Q9UBQ0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms