Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms