Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED17Q9NVC6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms