Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms