Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHST12Q9NRB3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms