Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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