Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE7BQ9NP56 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms