Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCL11BQ9C0K0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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