Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms