Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT27Q9BW83 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT27Q9BW83 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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