Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAGR1Q9BTK6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms