Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX2Q9BQ50 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms