Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOL4Q9BPW4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms