Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms