Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC9Q96Q05 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms