Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC85AQ96PX6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms