Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YTHDC1Q96MU7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms