Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms