Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q96MF0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q96MF0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q96MF0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q96MF0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q96MF0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms