Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP53Q96M91 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP53Q96M91 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms