Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT1Q96EB6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms